Das Einzugsgebiet des Wasserverbandes Millstätter See erstreckt sich vom Gebiet der Kurgemeinde Bad Kleinkirchheim im Osten über die Stadtgemeinde Radenthein bis in das Gegendtal mit den Gemeinden Feld am See und Afritz am See.

Westlich anschließend umfasst das Verbandsgebiet die Gemeinde Ferndorf mit einem Teilbereich am Ostufer des Millstätter Sees sowie die Marktgemeinden Millstatt am See und Seeboden. Entlang des Nordufers reicht das Einzugsgebiet bis zur Stadtgemeinde Spittal an der Drau. Das Südufer des Millstätter Sees mit den Bereichen Laggerbucht und Schlossvilla vervollständigt den gesamten Einzugsbereich des Verbandes.

Insgesamt umfasst das Verbandsgebiet eine Fläche von rund 360 km².

Neben der Betreuung der eigenen Anlagen betreibt das Personal der Abwasserbeseitigungsanlage (ABA) zusätzlich die Kanalanlagen des Wasserverbandes Lurnfeld–Reißeck.

Der Wasserverband Millstätter See betreibt und wartet insgesamt rund 640 Kilometer Kanalnetz.